La Incubadora de Empresas ha logrado un importante reconocimiento a nivel local, nacional e internacional.
Ha sido destacada por el Ministerio de Producción de la Nación como una de las 10 Incubadoras de Empresas con mayor actividad y mejor desempeño entre 489 Incubadoras acreditadas en el registro nacional.
A nivel internacional la UNESCO-IESALC seleccionó 9 Incubadoras destacadas de Latinoamérica y el Caribe y las invitó a participar en la Muestra Internacional de Experiencias Exitosas de Transferencia de Ciencia y Tecnología desde Instituciones de Educación Superior hacia el Sector Productivo – CRES- presentado en la ciudad de Cartagena de Indias, Colombia, en el marco de la II Conferencia Regional de Educación Superior de América Latina y el Caribe; y el premio INNOVAR en la categoría Vinculación y Transferencia Tecnológica organizado por el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva de la Nación.
Por su parte, el programa EMPRENDE U fue seleccionado por la Organización Universitaria Interamericana (OUI) entre las 34 propuestas finalistas para el Premio Interamericano de Innovación en Educación Superior, entre las 400 postulaciones recibidas, y fue invitado a realizar su presentación en el Seminario sobre Modelos Educativos Innovadores (MEIN) realizado en República Dominicana.
En el 2017 el Ministerio de Economía, Infraestructura y Energía de la Provincia de Mendoza le otorgó a la Incubadora de Empresas UNCUYO el reconocimiento a la incubadora con mayor cantidad de proyectos postulados y aprobados a la línea de financiamiento PIC primera edición.
También las empresas incubadas consiguieron más de 50 premios y reconocimientos de distintas instituciones entre las que se destacan el recibido en el COLOQUIO de IDEA a la Excelencia Institucional Empresaria; el premio al Liderazgo, Compromiso y Logros comerciales y empresariales otorgado por el Consejo Empresario Mendocino; Producto Innovador en el concurso INNOVAR , Jóvenes Emprendedores Santander; Emprendimientos Innovadores del Banco Nación; Naves, Bid Challenge, Desafío Intel Latinoamérica, Joven Empresario Argentino, IB50K del Instituto Balseiro, entre otros.