Funcionó en un principio en la Quinta Agronómica, en el año 1958 tenía la administración en una casa ubicada en calle Colón y Mitre y las actividades deportivas se realizaban en la calle Rondeau entre San Juan y San Martin de ciudad y posteriormente en el Club Pacífico. Desde 1969 pasaría al  espacio del predio de la Ciudad Universitaria que ocupa actualmente sobre la Avda. Champagnat. Institucionalmente, hoy depende de la Secretaría de Bienestar Universitario.
 
Su nivel de excelencia ha quedado demostrado a través de los equipos universitarios femeninos y masculinos destacados en deportes como voley, futsal, hockey sobre césped que han conseguido posicionarse entre los mejores equipos de su clase y, en varias oportunidades, han llegado a la cima del campeonato. También está el aporte individual, como el caso de Jesús Lugones, el joven de 16 años, que ha sido escogido como el mejor tirador juvenil de esgrima.
 
Cabe destacar que la Secretaría de Bienestar Universitario recibió el privilegio de obtener la sede para la realización de la vigésima tercera edición de los Juegos Interuniversitarios que se realizarán en el 2011.
 
El deporte universitario y federado, la salud deportiva y los programas turísticos son las alternativas que brinda la Dirección.
 
El deporte federado cuenta con más de 16 disciplinas y se caracteriza por  el entrenamiento permanente y la competencia, ya sea a nivel provincial o nacional. Futbol, voley, básquet, balonmano, hockey sobre césped, hockey sobre patines, rugby, karate y atletismo son algunos de los deportes que se practican en la “U”.
 
En el deporte universitario se practican andinismo, fútbol laboral, gimnasia y pesas, gimnasia aeróbica, natación, ping pong, tenis, vóley, entre otros.
 
El área de salud deportiva está conformada por profesionales en nutrición, kinesiología y medicina que se ocupan de realizar una evaluación deportiva constante de todos los socios de la institución. Asimismo, propone realizar caminatas, yoga y actividad física terapéutica para tener un corazón fuerte y sano.
 
El turismo de la UNCuyo ofrece distintos programas para disfrutar con la familia o con amigos. Desde hace más de 20 años, el turismo social es una opción diferente a la hora de viajar. En el último año, se sumaron a los clásicos destinos de Villa La Angostura, Puerto Madryn y Malargüe, las Cataratas del Iguazú, Ischigualasto y Talampaya, Valles Intermontanos y Laguna Brava.
 
Por otra parte, el programa de Deporte y Recreación Universitaria conjuga ambos aspectos para promover el encuentro social y cultural entre los universitarios. Las actividades están destinadas a los estudiantes y egresados y son gratuitas.
 
Entre sus actividades, incluye caminatas andinas, ascensiones, campamentos, juegos deportivos y recreativos, salidas a la precordillera y Cerro Aconcagua, reconocimiento de flora y fauna autóctona y actividades artísticas
 
El Programa de Actividad Física, a su vez, tiene por objetivo integrar a la comunidad universitaria por medio de la práctica de actividades que tienen como pilares el bienestar y la salud, a través de caminatas, campamentos, deportes grupales, ascensiones, talleres educativos, excursiones a Vallecitos y el Cerro Arco y prácticas en el gimnasio.