Roberto Vallés nació en San Juan, el 10 de enero de 1950, y estudió Medicina en la Universidad Nacional de Córdoba, donde se graduó en el año 1973.
Fue residente de Medicina Interna en el antiguo Hospital Ferroviario, y se especializó en Inmunología. Fue docente y director del Instituto de Inmunología de la Facultad y Jefe del Servicio en el Hospital Central, donde, desde 2005, se desempeñó como profesor titular del Instituto de Inmunología.
Se desempeñó como decano de la Facultad de Ciencias Médicas durante dos períodos que comenzaron en el 2008 y concluyeron en el 2014.